Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PCNX1Q96RV3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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