Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBGCP5Q96RT8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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