Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTUB2Q96DC9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTUB2Q96DC9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms