Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATA6Q92908 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GATA6Q92908 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GATA6Q92908 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GATA6Q92908 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GATA6Q92908 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GATA6Q92908 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA6Q92908 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA6Q92908 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA6Q92908 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA6Q92908 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA6Q92908 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA6Q92908 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA6Q92908 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA6Q92908 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GATA6Q92908 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms