Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms