Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.07■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LCN9Q8WX39 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCN9Q8WX39 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms