Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SELENOMQ8WWX9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SELENOMQ8WWX9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms