Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC3Q8TF64 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GIPC3Q8TF64 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms