Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM35BQ8NCS4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms