Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AVL9Q8NBF6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms