Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC33Q8N5R6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms