Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms