Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLD3Q8IV08 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms