Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CATSPER4Q7RTX7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms