Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms