Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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ZNF549Q6P9A3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF549Q6P9A3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF549Q6P9A3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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