Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
RFTN2Q52LD8 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms