Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms