Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms