Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
MSMPQ1L6U9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms