Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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SGCBQ16585 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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SGCBQ16585 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SGCBQ16585 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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