Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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ZFHX3Q15911 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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ZFHX3Q15911 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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ZFHX3Q15911 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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ZFHX3Q15911 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ZFHX3Q15911 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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