Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCN9AQ15858 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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