Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms