Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SYCP1Q15431 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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