Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARHGEF6Q15052 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARHGEF6Q15052 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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