Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB3GAP1Q15042 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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