Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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COL4A6Q14031 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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COL4A6Q14031 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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COL4A6Q14031 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL4A6Q14031 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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