Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms