Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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FHL3Q13643 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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FHL3Q13643 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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FHL3Q13643 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FHL3Q13643 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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