Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 LINC01715-201ENST00000420776 624 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AL009172.1-201ENST00000436365 1098 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC006355.1-201ENST00000440982 1012 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC018362.1-201ENST00000564805 846 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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MKRN4PQ13434 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 PYM1-202ENST00000398213 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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MKRN4PQ13434 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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MKRN4PQ13434 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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MKRN4PQ13434 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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MKRN4PQ13434 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 EAPP-205ENST00000618169 1237 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.125-201ENST00000618659 283 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 C1orf132-204ENST00000637970 1170 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MKRN4PQ13434 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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