Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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UBE2V1Q13404 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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UBE2V1Q13404 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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UBE2V1Q13404 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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