Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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ITGB3BPQ13352 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGB3BPQ13352 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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