Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM32Q13049 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms