Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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