Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFEMP1Q12805 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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