Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms