Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms