Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNG1Q06432 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms