Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPN12Q05209 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms