Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP7AQ04656 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms