Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARDQ03181 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms