Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PLOD1Q02809 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms