Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XPCQ01831 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XPCQ01831 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
XPCQ01831 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
XPCQ01831 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
XPCQ01831 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
XPCQ01831 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
XPCQ01831 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms