Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MDM2Q00987 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms