Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK16Q00536 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms