Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIMK2P53671 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIMK2P53671 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIMK2P53671 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIMK2P53671 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIMK2P53671 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIMK2P53671 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIMK2P53671 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIMK2P53671 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIMK2P53671 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIMK2P53671 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIMK2P53671 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIMK2P53671 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIMK2P53671 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIMK2P53671 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIMK2P53671 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIMK2P53671 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIMK2P53671 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIMK2P53671 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIMK2P53671 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIMK2P53671 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIMK2P53671 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIMK2P53671 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIMK2P53671 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms