Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM5CP41229 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms