Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ETFBP38117 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms