Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FDFT1P37268 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms